Экспедиция на НИС «Папанин» с 27 июня по 04 июля 2022 г.

Были проведены экспедиционные работы по сбору образцов губок оз. Байкал для геномных, транскриптомных и метагеномных исследований эволюции, симбиоза и стрессового ответа. Работы выполнены в рамках темы государственного задания № 0279-2021-0011 «Геномика симбиоза. Исследование взаимодействий между хозяином и консорциумами микроорганизмов и паразитов» (рук. Беликов С.И.) и гранта РНФ № 22-24-01037 «Создание задела в области использования ddRAD секвенирования для анализа филогении Lubomirskiidae.» (рук. Ицкович В.Б.).

Проведен сбор губок семейств Lubomirskiidae и Spongillidae для анализа биоразнообразия и эволюции методами геномного и транскриптомного анализов. Сбор проводился на 12 станциях Южного, Среднего и Северного Байкала на глубинах от 1 до 30 м. На 8 станциях также отобраны пробы воды для сравнительного анализа микробиома губок и воды. Проведены краткосрочные эксперименты по влиянию на губок температурного и химического стресса. Выполнен сбор больных и здоровых губок, а также внешне здоровых губок из районов с разными экологическими характеристиками для изучения транскриптомики и метагеномики стрессового ответа. Отмечено наличие больных губок как в районах, подверженных антропогенному влиянию (п. Листвянка), так и в экологически благоприятных районах (м. Турали, м. Елохин, м. Ижимей). Проведено выделение высококачественной ДНК для анализа генов синтеза БАВ в губках геномными методами. Согласно предварительным результатам, собранные образцы относятся как минимум к 10 видам Lubomirskiidae и Spongillidae. Образцы L.baikalensis, B.intermedia и B.bacillifera являются наиболее многочисленными. Проведен сбор образцов нескольких видов губок для геномного ddRAD анализа внутри- и межвидовых эволюционных отношений байкальских губок.