Таблица школа ДНК Баркодинга
№ занятия | Тема занятия | Файл с презентацией | Преподаватель |
---|---|---|---|
1 | Использование командной строки в обработке геномных данных. | к.т.н. И.С. Петрушин (ИГУ) | |
2 | Удаленный доступ к высокопроизводительным компьютерам под управлением операционной системы Linux. | Тема 2 |
к.т.н. И.С. Петрушин (ИГУ) |
3 | Введение в язык программирования R. https://vkvideo.ru/video5658227_456239342 | к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) | |
4 | ДНК-баркодинг: маркеры, эволюционные дистанции и идентификация видов. https://vkvideo.ru/video5658227_456239341 | к.б.н. Т. Е. Перетолчина (ЛИН СО РАН) | |
5 | Базы данных для метабаркодинга, автоматизация сопоставления собственных данных с базами данных, приложение BLAST. https://vkvideo.ru/video5658227_456239340 | к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) | |
6a | Метабаркодинг: основные принципы, цели и задачи, высокопроизводительное секвенирование.https://vkvideo.ru/video5658227_456239343 https://vkvideo.ru/video5658227_456239351 | к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН), к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) | |
6b | Метабаркодинг: основные принципы, цели и задачи, высокопроизводительное секвенирование.https://vkvideo.ru/video5658227_456239343 https://vkvideo.ru/video5658227_456239351 | к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН), к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) | |
7а | Использование программы USEARCH в анализе данных метабаркодинга https://vkvideo.ru/video5658227_456239348 | к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН), к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) | |
7b | Использование программы USEARCH в анализе данных метабаркодинга | к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН), к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) | |
8а | Использование пакета dada2 в анализе данных метабаркодинга. https://vkvideo.ru/video5658227_456239349 | к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) | |
8b | Использование пакета dada2 в анализе данных метабаркодинга. | к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) | |
9 | Теория. Методы вычислительной экологии, многомерной статистики, корреляционного анализа для интерпретации результатов метабаркодинга | Тема 9 |
к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) |
10 | Практика. Методы вычислительной экологии, многомерной статистики, корреляционного анализа для интерпретации результатов метабаркодинга | Тема 10 |
к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) |
11 | Предсказание функциональной активности бактериальных сообществ по результатам ДНК-метабаркодинга с применением маркера 16s rRNA | Тема 11 |
к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН) |
12 | Семинар - обмен опытом. ДНК-баркодинг для идентификации и уточнения таксономического статуса байкальских беспозвоночных животных | Тема 12 |
к.б.н. Т. Е. Перетолчина (ЛИН СО РАН) |
13 | Семинар - обмен опытом. ДНК-баркодинг и метабаркодинг в исследовании почвенных цианобактерий и микроводорослей | Тема 13 |
к.б.н. А.Д. Темралеева (ИБФМ РАН) |
14 | Семинар – обмен опытом. ДНК-метабаркодинг в исследовании микробных сообществ водной толщи оз. Байкал | Тема 14 |
к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН) |
15 | Семинар – обмен опытом. ДНК-метабаркодинг в исследовании сообществ микроэукариот водной толщи оз. Байкал | Тема 15 |
к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН) |
16 | Семинар – обмен опытом. ДНК-метабаркодинг в исследовании структуры бентосных сообществ беспозвоночных животных оз. Байкал | Тема 16 |
к.б.н. Т. Е. Перетолчина (ЛИН СО РАН) |